Пользуясь языком предков, навахо все еще говорят так же, как и сотни лет тому назад. Язык навахо произошел от диалекта языковой группы, известной как атабаскская. Лингвистические исследования показали существование связи между двумя племенами: современные навахо легко могут прочитать древние наскальные письмена, которые в обилии находят в юго-западной части страны. Язык навахо считается одним из самых сложных и трудных для изучения. Он близок к языку апачей, но другим языкам североамериканских индейцев не родственен. Первая известная запись о языке племени навахо была сделана в 1849 году, когда его упомянул в «Вестнике военной разведки» лейтенант Джеймс Симпсон. В этом тексте был опубликован словарик.

Миссионеры развивали и создавали собственные формы произношения и грамматики, записывая различные религиозные тексты и словари. В конечном итоге стало понятно, что необходим стандартный алфавит. Джон Кольер, глава департамента по делам индейцев, и Уиллард Битти, глава бюро образования индейцев, наняли четверых ученых, чтобы те создали алфавит навахо, опубликовали исследования о языке и соответствующие документы. Впрочем, обучение грамоте и вновь созданный алфавит не приобрели особой популярности у самих членов племени.